瓊林萬祠宮又稱萬士爺宮，緣於明嘉靖三十九年倭亂時，瓊林鄉民為抵禦外侮，奮力抵抗保護鄉梓而英勇犧牲者，有不少是未成家的年輕人，囿於習俗未成家室不入宗祠，後人為表感念，乃建萬祠宮，崇祀鄉賢及各方無主遊魂，題廟額為「奠厥攸居」。
