本園區的誕生源於白色恐怖時代兩個「政治犯監獄」拘禁許多「政治犯」，第一個是台灣省保安司令部新生訓導處(1951年-1965年)，反映世界冷戰時代台灣在亞洲地區的孤立境，第二個是國防部綠島感訓監獄(1972年-1987年，綠洲山莊)，正是國際人權行動者協助救援臺灣政治犯的國際人權潮流興起的時代。戰後台灣人侵害的歷史，具體而微反映在本園區的遺址及展示活動。園區將以人民追求民主自由的歷史真相為依據，藉助博物館蒐藏、研究、展示、觀眾溝通與詮釋活動，經營白色恐怖時代「政治犯」監獄的歷史遺址，致力於臺灣近代歷史的詮釋及研究，推動人權與環境權教育，增進我國國民的人權意識，促進國際和平文化交流，讓每一位來訪者認知民主得來不易。